JavaScriptとはPC側で動かすプログラミング（スプリクト）言語の事です。
ちなみにサーバー側で動かすCGIはほぼPerl（パール）で動かします。
サーバーに負担が掛かりCGIを禁止している所がよくありますが、
JavaScriptは見ている側で動かすので問題はありません。
JavaScriptを使うにあたっての注意点を言うと、
<script language="javascript">タグを使う時、
src=で呼び出さない場合、基本的には<head>の中にタグを入れてください。
また、<script>でタグの中身を書く場合は必ず
<!--*****//-->コメントで閉じて、
尚且つ//スラッシュ2本が必要になります。
（.jsで呼び出した場合は逆にエラーになります）
後は、JavaScriptを切っている・切られている状態だと、
表示されない・ボタンが押せないなどの問題が出てきますので注意してください。
簡単にまとめると・・・
■JavaScript
【良い点】 サーバーに負担かけない、動作が速い、ある程度CGIのマネをできる…
【悪い点】 複雑なプログラムにするとPCがフリーズする、切られていると使えない…
■CGI
【良い点】 HTMLで出来ない事ができる、自動処理（掲示板、カウンター、検索エンジン等…）
【悪い点】 無料HPではほぼ使えない、負担掛けすぎるとサーバーダウンする、テストが大変…
簡単にまとめましたけど、JavaScriptはかなり使えます！
次のページにタグを書いてあるのでよければ見てくださいね（＾＾
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